Existen algunas enfermedades que presentan tendencia a la asociación con la  Enfermedad Celiaca, es decir, dentro del grupo de personas que padecen algunas de esas enfermedades la posibilidad de padecer Enfermedad Celiaca es superior en varios puntos, dependiendo de cuál sea,  a lo que sería lo normal en la población que no las padece.  Por esta razón conforman un grupo de riesgo que debe prestar especial atención a la posibilidad de desarrollar la Enfermedad.

Las más características son:

• Dermatitis Herpetiforme.
• Diabetes Mellitus Tipo I
• Intolerancia a la lactosa.
• Déficit selectivo de IgA.
• Síndrome de Down.
• Enfermedad Hepática.
• Enfermedades de tiroides.

Otras con menos incidencia:

• Vitíligo.
• Artritis reumatoide.
• Lupus eritematoso sistémico.
• Síndrome de Sjögren.
• Enfermedad de Addison.
• Nefropatía por IgA.
• Encefalopatía progresiva.
• Síndromes cerevelosos.

Aunque existe esa posibilidad de asociación y siempre deba tenerse en cuenta, los porcentajes siguen siendo pequeños y la gran mayoria de celiacos no tiene por qué desarrollar ninguna otra enfermedad, ni vicebersa.